Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTGIRP43119 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGIRP43119 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms