Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MDH1P40925 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms