Protein–RNA interactions for Protein: P40259

CD79B, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD79BP40259 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD79BP40259 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms