Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms