Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCAP28676 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCAP28676 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms