Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms