Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALM2P0DP24 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms