Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPR89BP0CG08 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPR89BP0CG08 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms