Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN9O95484 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN9O95484 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN9O95484 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN9O95484 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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