Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms