Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 326.56■■□□□ 1.847e-17■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.757e-17■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.93□□□□□ -1.147e-17■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SPHK1-206ENST00000590379 588 ntTSL 320■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SPHK1-208ENST00000591651 541 ntTSL 419.9■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SPHK1-209ENST00000591762 2502 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SPHK1-205ENST00000588682 858 ntTSL 317.84■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 DHRS2-206ENST00000556550 2595 nt14.88□□□□□ -0.033e-11■□□□□ 10.4
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PRPF4O43172 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.543e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.873e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.777e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-22■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.32□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-22■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CCDC88A-211ENST00000471947 3713 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.185e-22■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.255e-22■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.355e-22■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.725e-22■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 BCAM-205ENST00000589558 611 ntTSL 218.96■□□□□ 0.631e-11■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SYMPK-209ENST00000598155 1603 ntTSL 519.11■□□□□ 0.658e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 THOP1-210ENST00000590533 616 ntTSL 215.99■□□□□ 0.151e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 THOP1-213ENST00000591363 639 ntTSL 515.79■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 215.48■□□□□ 0.078e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 515.03■□□□□ -08e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 THOP1-212ENST00000591149 789 ntTSL 314.5□□□□□ -0.091e-8■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SYMPK-211ENST00000598364 995 ntTSL 313.82□□□□□ -0.28e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.38e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.898e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.438e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 35.79□□□□□ -1.488e-10■□□□□ 10.4
PRPF4O43172 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.184e-17■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-17■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-17■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.744e-17■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 58.86□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 MTG1-207ENST00000495014 871 ntTSL 317.83■□□□□ 0.443e-11■□□□□ 10.3
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PRPF4O43172 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 219.02■□□□□ 0.643e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.083e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.713e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 TRIO-221ENST00000513206 7995 ntTSL 517.03■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 10.3
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PRPF4O43172 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.771e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.012e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RBL1-204ENST00000527999 599 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-7■□□□□ 10.3
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PRPF4O43172 PMM2-212ENST00000566604 986 ntTSL 215.24■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-211ENST00000566540 1557 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-202ENST00000562025 569 ntTSL 414.41□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-203ENST00000562318 931 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DENND4B-202ENST00000368646 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.09□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DENND4B-210ENST00000485359 891 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.382e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-207ENST00000565221 793 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.659e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-213ENST00000566983 907 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 PMM2-217ENST00000570076 1002 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 FASN-208ENST00000635733 100 ntTSL 58.11□□□□□ -1.111e-16■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ABCA5-207ENST00000588665 560 ntTSL 519.38■□□□□ 0.696e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ABCA5-209ENST00000589609 631 ntTSL 313.36□□□□□ -0.276e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ABCA5-212ENST00000592568 616 ntTSL 313.34□□□□□ -0.276e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ABCA5-213ENST00000593153 3017 ntTSL 211.71□□□□□ -0.536e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ABCA5-205ENST00000587607 804 ntTSL 1 (best)5.61□□□□□ -1.516e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.176e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 ITIH3-210ENST00000495622 920 ntTSL 514.11□□□□□ -0.158e-13■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.94□□□□□ -1.623e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 SON-206ENST00000429093 684 ntTSL 512.78□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 SON-209ENST00000457208 765 ntTSL 37.95□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 SON-211ENST00000467616 676 ntTSL 55.24□□□□□ -1.572e-6■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DNAJC11-204ENST00000451196 1357 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.681e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DNAJC11-210ENST00000473993 755 ntTSL 511.88□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 DNAJC11-203ENST00000426784 975 ntTSL 37.17□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 HSP90B1-206ENST00000550479 698 ntTSL 25.12□□□□□ -1.592e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 AP1G2-212ENST00000554554 2955 ntTSL 29.91□□□□□ -0.825e-9■□□□□ 10.3
PRPF4O43172 TNRC18-204ENST00000413081 925 ntTSL 317.89■□□□□ 0.454e-6■□□□□ 10.2
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