Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTDSP2O14595 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTDSP2O14595 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTDSP2O14595 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTDSP2O14595 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTDSP2O14595 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTDSP2O14595 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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