Protein–RNA interactions for Protein: O00623

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX12O00623 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX12O00623 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PEX12O00623 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PEX12O00623 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PEX12O00623 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX12O00623 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX12O00623 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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