Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DGG1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DGG1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DGG1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DGG1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms