Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLCA1A8K7I4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms