Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms