Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPQQ9Y646 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPQQ9Y646 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms