Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF2Q9Y5W3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF2Q9Y5W3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms