Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTDP1Q9Y5B0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDP1Q9Y5B0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDP1Q9Y5B0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms