Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2E1Q9Y466 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2E1Q9Y466 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR2E1Q9Y466 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms