Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDGFL3Q9Y3E1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDGFL3Q9Y3E1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms