Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM2Q9Y2K5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM2Q9Y2K5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM2Q9Y2K5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms