Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSX2IPQ9Y2D8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms