Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP2BQ9UQN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP2BQ9UQN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms