Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB2Q9UPW6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB2Q9UPW6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms