Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF8Q9UPN6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAF8Q9UPN6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms