Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPK3Q9UPE1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPK3Q9UPE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPK3Q9UPE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms