Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MYO5BQ9ULV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MYO5BQ9ULV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MYO5BQ9ULV0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MYO5BQ9ULV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYO5BQ9ULV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYO5BQ9ULV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MYO5BQ9ULV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MYO5BQ9ULV0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms