Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCC3Q9ULS5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCC3Q9ULS5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCC3Q9ULS5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms