Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES3Q9UL19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARRES3Q9UL19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RARRES3Q9UL19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms