Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAV3Q9UKW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAV3Q9UKW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV3Q9UKW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms