Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPREB3Q9UKI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPREB3Q9UKI3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms