Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3LQ9UJW3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3LQ9UJW3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms