Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HERC5Q9UII4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
HERC5Q9UII4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HERC5Q9UII4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERC5Q9UII4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms