Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAI1Q9UI46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAI1Q9UI46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAI1Q9UI46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms