Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPN3Q9UHW5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPN3Q9UHW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms