Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO40Q9UH90 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms