Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS7AQ9UBW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS7AQ9UBW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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