Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EIF3KQ9UBQ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms