Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCD2Q9UBJ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD2Q9UBJ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms