Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MYO1AQ9UBC5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms