Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A6Q9P2U8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC17A6Q9P2U8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms