Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGAP28Q9P2N2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP28Q9P2N2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP28Q9P2N2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms