Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC59Q9P031 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms