Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EHD3Q9NZN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms