Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms