Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC28Q9NX36 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJC28Q9NX36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC28Q9NX36 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms