Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAK1IP1Q9NWT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK1IP1Q9NWT1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms