Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBCCD1Q9NVR7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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