Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKDREJQ9NTG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKDREJQ9NTG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKDREJQ9NTG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PKDREJQ9NTG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKDREJQ9NTG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms